2020年5月4日，國際學術期刊Nature Metabolism在線發(fā)表了中國科學院上海營養(yǎng)與健康研究所丁秋蓉研究組的研究論文“MRG15 orchestrates rhythmic epigenomic remodeling and controls hepatic lipid metabolism”。該研究發(fā)現(xiàn)MRG15作為一個進化上保守的表觀調(diào)控因子在調(diào)控肝臟組織染色質(zhì)開放狀態(tài)和脂代謝基因轉錄活性的節(jié)律性振蕩中行使重要的分子開關作用。研究提示MRG15復合物在肝臟組織感應外界營養(yǎng)狀態(tài)，并在營養(yǎng)豐富環(huán)境下進行有效能量儲存的過程中起重要作用。該研究為營養(yǎng)過剩環(huán)境下脂質(zhì)代謝紊亂導致的代謝性疾病提供了新的分子靶標。
地球自轉產(chǎn)生了晝夜交替，在長期的進化過程中，生物體產(chǎn)生了生物鐘節(jié)律系統(tǒng)，使得行為和生理進程同步于光線的周期變化，以使能量的儲存和利用達到最優(yōu)狀態(tài)。前期研究發(fā)現(xiàn)全基因組范圍內(nèi)的染色質(zhì)開放和閉合，RNA聚合酶II的基因組結合和新生轉錄活性呈現(xiàn)明顯的晝夜節(jié)律。以肝臟為例，基因表達譜分析發(fā)現(xiàn)5-20%的基因在肝臟組織中存在24h的振蕩表達，且其中大多數(shù)基因?qū)Υx有重要調(diào)控作用，說明染色質(zhì)重塑層面的晝夜節(jié)律調(diào)控在外周代謝組織中（如肝臟）對代謝基因的整體轉錄調(diào)控，繼而能量的儲存和消耗平衡非常重要。而外周代謝組織如何感應外界營養(yǎng)狀態(tài)的節(jié)律性變化，并在染色質(zhì)重塑層面做出及時響應是代謝領域有待回答的基本問題。
MRG15是一個進化上非常保守的表觀調(diào)控因子，前期被發(fā)現(xiàn)參與調(diào)控細胞增殖、DNA修復和個體發(fā)育過程。雖然MRG15基因附近的基因組區(qū)域在人類遺傳學中被鑒定為心血管疾病易感區(qū)域，但尚缺乏針對MRG15在代謝中的功能研究。研究人員在系統(tǒng)檢測MRG15基因組結合位點時發(fā)現(xiàn)，在肝臟組織中MRG15結合在多個重要脂代謝基因啟動子和增強子區(qū)域，并同時發(fā)現(xiàn)一個有趣的現(xiàn)象：MRG15的基因組結合呈現(xiàn)明顯的節(jié)律性——在小鼠夜間進食狀態(tài)下，MRG15結合的基因組位點超過1萬個；而在白天非進食狀態(tài)下，MRG15的基因組結合位點只有57個；而改變進食時間能明顯改變MRG15基因組結合的節(jié)律性。進一步的研究發(fā)現(xiàn)，MRG15與基因組的節(jié)律性結合可促進染色質(zhì)開放，增強RNA聚合酶II的基因組結合，提高基因轉錄活性；而在MRG15敲除的肝臟組織中，全基因組范圍內(nèi)Pol II基因組結合的節(jié)律性被明顯破壞，多個脂代謝基因表達顯著降低，提示MRG15在節(jié)律性染色質(zhì)重塑和脂代謝基因表達調(diào)控中起關鍵作用。
研究人員進一步針對導致MRG15節(jié)律性基因組結合上游機制進行了研究，初步發(fā)現(xiàn)肝臟核受體LRH-1（又名NR5A2）部分介導了MRG15在脂代謝基因轉錄調(diào)控區(qū)域的結合。LRH-1與MRG15存在蛋白相互作用，實驗結果顯示LRH-1的蛋白表達量以及LRH-1與MRG15的蛋白相互作用明顯受節(jié)律和上游營養(yǎng)信號調(diào)控，提示了一種經(jīng)由LRH-1調(diào)控MRG15基因組結合的上游營養(yǎng)感應機制。
當通過CRISPR技術在成體小鼠肝臟組織里敲除MRG15進而抑制這一過程后，小鼠能明顯抵抗高脂飲食導致的肝臟脂肪積累，改善代謝平衡。更有意思的是，F(xiàn)DA批準的藥物阿加曲班（argatroban）被發(fā)現(xiàn)可以高親和力結合MRG15，抑制MRG15的功能，從而有效抑制肝臟脂滴積累，提示MRG15是一個成藥性較強的分子靶點。綜上，此項研究揭示了肝臟細胞感應上游營養(yǎng)信號，并在染色質(zhì)重塑水平作出及時響應的一種傳導機制和其間關鍵銜接因子MRG15。
中國科學院上海營養(yǎng)與健康研究所韋余達、田程和趙永旭為該論文的共同第一作者，丁秋蓉研究員為論文通訊作者。這項工作得到了中國科學院上海營養(yǎng)與健康研究所應浩研究員、上海交通大學附屬第六人民醫(yī)院劉峰博士和復旦大學于文強教授的大力幫助。該研究還得到了科技部、國家自然科學基金委及中國科學院等項目的資助，同時也得到了中國科學院上海營養(yǎng)與健康研究所公共技術平臺和動物平臺的支持。
原文鏈接：https://www.nature.com/articles/s42255-020-0203-z
圖1. MRG15是調(diào)控肝臟節(jié)律性染色質(zhì)重塑和脂代謝基因表達的表觀分子開關。
官方微信
